事实上，人文科学研究与自然科学研究不同之外还在于，人文科学的研究，无论是哲学的、文学的、还是历史学的，其研究与认识活动都有反思与批判的色彩，总带有对认识对象的现实既存状态的批判性和超越性态度。自然科学与社会科学必须而对现实、实事求是。人文科学不是反映现实的物质世界和客观既存的事实，它主要不是对世界既存状态之“如何”的客观说明，而更多地是以自己持有的理想、情感、价值尺度来对外部世界之“应该如何”的主体构建，更多地追求着理想和自由意志，期盼着对现实的超越，赋予人生和世界以更多的幻想和浪漫色彩。人文科学家总会把自己的理想、价值追求赋予他的研究对象，从而使人文科学带有较强烈的主体构建性和选择性。与自然科学和社会科学主要是对研究对象的真实状态作客观的反映不同，人文科学与现实的关系总带有一层研究者主体的选择性与超越性色彩，而人文作品的读者本身对人文作品的阅读与理解本身，也不可避免地带上读者主体性价值阐释与审美再创造的特点。在人文科学的世界里，人文科学家、人文科学家的成果作品、接受阅读这些成果作品的读者，这三者之间存在着更为复杂的双向渗透关系。人文科学总是力图透过客观事实的世界，去构造一个理想的世界、价值的世界和意义的世界。这个理想世界当然不是随意编造的乌托邦幻想，不是完全离开客观物质世界和经验事实的主观臆想，它立足于现实但却又具有它的超越性和理想性，是一种情感与理性互动的产物。因此，在人文科学研究领域，不仅是运用事实、原因、规律等概念，但更多的是使用意义、价值、理想、意志、情感、人性、人格、尊严、善恶、美丑等概念，去理解体验人类的精神生活、文学情感、历史观念、审美意识、宗教信仰等文化世界，去对人类生存的价值和生命的意义进行探索，构建一个理想的人文精神世界，以满足人类在精神和理想方面的需要。