同时，还要强调的是，企业在执行过程中仍需要注意企业建立内部控制体系的目的：一是对风险的防范，为企业实现经营目标提供合理保证，而不是为了控制而控制；二是要提高企业的工作效率，获得更好的工作效果，而不是调整权责，增加限制。
为了使企业获得内控体系建设最佳实践的指导，《上海证券交易所上市公司内部控制指引》也鼓励企业聘请中介机构协助建立内控制度，并提出在信息披露中必须有中介机构对企业内部控制提出的审核评价意见。
2006年9月28日，同样为了加强上市公司内部控制，促进上市公司规范运作和健康发展，保护投资者合法权益，根据《公司法》《证券法》等法律、行政法规、部门规章和《深圳证券交易所股票上市规则》，深交所发布了《深圳证券交易所上市公司内部控制指引》，要求深市主板上市公司自今日至2007年6月30日期间建立起完备的内部控制制度，并从2007年年报开始，按照内控指73◆◆◆企业会计信息化内部控制问题研究引的要求披露内控制度制定和实施情况。